92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0016 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    91.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0071  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0838  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.30479e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0694  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.108922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0037  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1187  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>