69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_R0020 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0037  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1413  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.192741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t18  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>