127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflt010 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0408  tRNA-Leu  91.01 
 
 
89 bp  113  7.000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.22 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 
86 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  94.29 
 
 
89 bp  54  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  89.36 
 
 
86 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  92.11 
 
 
84 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  89.13 
 
 
87 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  94.74 
 
 
88 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  90.24 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  90.24 
 
 
92 bp  50.1  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  81.93 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t035  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t036  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t043  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0023  tRNA-Leu  89.74 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t066  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000841762  hitchhiker  0.00000000876974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0057  tRNA-Leu  93.55 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.428944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0066  tRNA-Leu  93.55 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000463268  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0084  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0085  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000347265  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0092  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118641  hitchhiker  0.00000124407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0084  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000189086  normal  0.285336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0085  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00198738  normal  0.283647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0098  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00669623  hitchhiker  0.0018362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0053  tRNA-Leu  93.55 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0081  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027716  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0082  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0089  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000116077  normal  0.0210623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  81.93 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t01  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0045  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0056  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000431173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0057  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000366309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0044  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000971142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0045  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0059  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t065  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000716736  hitchhiker  0.00000000861256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0061  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000343038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0066  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000102831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0067  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  81.93 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0071  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000142441  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0076  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0077  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  89.74 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  88.1 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  89.47 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  91.18 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  89.47 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  88.1 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>