156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0796 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  89.66 
 
 
87 bp  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  88.57 
 
 
87 bp  75.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  85.06 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  90.74 
 
 
89 bp  67.9  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  93.18 
 
 
82 bp  63.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  83.91 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  83.91 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  94.74 
 
 
84 bp  60  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  87.14 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0067  tRNA-Leu  92.86 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50283  hitchhiker  0.00109765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0014  tRNA-Leu  90.91 
 
 
84 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061213  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  96.88 
 
 
84 bp  56  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  90.91 
 
 
87 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0003  tRNA-Leu  94.29 
 
 
82 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.27251  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  96.77 
 
 
89 bp  54  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  82.76 
 
 
87 bp  54  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  86.44 
 
 
87 bp  54  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  92.31 
 
 
83 bp  54  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0004  tRNA-Leu  94.29 
 
 
82 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  90.7 
 
 
87 bp  54  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0038  tRNA-Leu  96.67 
 
 
84 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal  0.0114921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0062  tRNA-Leu  90.48 
 
 
86 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.185406  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  90.48 
 
 
86 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  96.67 
 
 
88 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  90.24 
 
 
82 bp  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0643  tRNA-Leu  91.89 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  83.82 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  93.75 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    93.75 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0243  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  96.43 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  93.75 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  93.75 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_003295  RS03938  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  81.61 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  93.55 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  93.55 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>