141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_tRNALeuVIMSS1309350 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  89.04 
 
 
89 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  95.45 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  97.37 
 
 
89 bp  67.9  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  97.3 
 
 
90 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  97.3 
 
 
90 bp  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  97.3 
 
 
90 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  97.3 
 
 
90 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  97.3 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  97.3 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.22 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  97.22 
 
 
86 bp  63.9  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  86.75 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.59 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  94.59 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  94.59 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  94.59 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  94.59 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  94.59 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  94.59 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  94.59 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  94.29 
 
 
89 bp  54  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  54  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  84.81 
 
 
88 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  94.29 
 
 
92 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  96.67 
 
 
86 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  82.93 
 
 
89 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  92.11 
 
 
89 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  92.11 
 
 
89 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0003  tRNA-Leu  92.11 
 
 
92 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  90.48 
 
 
84 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294386  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  93.94 
 
 
82 bp  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  93.94 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t18  tRNA-Leu  91.67 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04001  tRNA-Leu  93.55 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000386269  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  91.43 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0015  tRNA-Leu  93.55 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.38953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>