20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_R0037 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  97.7 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  90 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  81.4 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>