65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_R0044 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  93.83 
 
 		 84 bp  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>