131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0020 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  86.25 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0028  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  83.82 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00069  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000211563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.44875e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0017  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00783085  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0174601  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  83.54 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0544  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5114  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1619  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0724475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0095  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0436868  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4957  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4213  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4911  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000387587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4962  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000175711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4806  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4807  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000360062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4875  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000898834  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4968  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000650666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4969  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000625029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5234  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000900844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>