42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R29 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0457  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.174165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0060  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000227715  normal  0.912821 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0010  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00911881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0041  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>