29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0039 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0035  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185716  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0035  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0038  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0064  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  82.86 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  82.86 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>