20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_R0038 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185716  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 83 bp  95.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0026  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14019  tRNA-Leu  90.38 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.458455 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  100 
 
 		 489 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6024  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658515  normal  0.58924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>