22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_R0018 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  87.21 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>