79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0016 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  87.21 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  86.25 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0064  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0003  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  83.82 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  83.87 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0552  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0183595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>