89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_R0003 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  98.81 
 
 		 87 bp  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 84 bp  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  98.63 
 
 		 86 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  98.63 
 
 		 86 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  96.2 
 
 		 86 bp  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  94.94 
 
 		 86 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  97.1 
 
 		 86 bp  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  93.67 
 
 		 86 bp  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0003  tRNA-Leu  96.72 
 
 		 83 bp  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  94.52 
 
 		 83 bp  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  92.41 
 
 		 83 bp  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  91.14 
 
 		 83 bp  93.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0003  tRNA-Leu  92.19 
 
 		 83 bp  87.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 83 bp  79.8  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 83 bp  79.8  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0073  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357526  normal  0.875145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0003  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0063  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0050  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  85 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  83.54 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  82.28 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.787126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>