297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0025 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 83 bp  89.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 84 bp  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 83 bp  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0013  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0022  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4585  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  86.25 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  86.25 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000114198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0552  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0183595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584266  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000286761  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>