224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_R0031 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0071  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 84 bp  97.6  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  92.42 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  89.71 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  89.71 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  89.71 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  89.71 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  89.71 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0552  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0183595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03938  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0015  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0021  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144859  normal  0.471234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0025  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132297  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0041  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0026  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>