More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0017 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 83 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  95.83 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  90 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  87.18 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  87.18 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>