149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0051 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  91.86 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 85 bp  91.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4326  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92812  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0025  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121967  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0013  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0899953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000157921  normal  0.648742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>