202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0044 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  89.7  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  89.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 81 bp  81.8  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  91.53 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 80 bp  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>