160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0023 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  92.42 
 
 
82 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  92.42 
 
 
85 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  89.74 
 
 
84 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  90.91 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  88.16 
 
 
84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  88.16 
 
 
84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  88.16 
 
 
84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  88.16 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  88.16 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  88.16 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  89.55 
 
 
81 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  89.55 
 
 
81 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  89.55 
 
 
84 bp  69.9  0.00000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  89.55 
 
 
81 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  89.55 
 
 
81 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  89.55 
 
 
81 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  89.55 
 
 
81 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  87.18 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  93.48 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  95.65 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  95.65 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  93.48 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  89.66 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  93.48 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  87.69 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  87.69 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  86.57 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  97.14 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  86.57 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  92.86 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  94.74 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  86.36 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  91.3 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  91.3 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  87.93 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  93.48 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.97 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  89.23 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  86.15 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  94.59 
 
 
81 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  96.97 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  94.59 
 
 
82 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  96.97 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  96.97 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  86.15 
 
 
82 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  96.97 
 
 
82 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  86.15 
 
 
82 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  86.76 
 
 
83 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.53 
 
 
84 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.53 
 
 
84 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  85.53 
 
 
84 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.53 
 
 
84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  85.53 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  85.53 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  85.53 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  85.53 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  85.53 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  85.53 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  86.76 
 
 
83 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  85.53 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  87.1 
 
 
83 bp  54  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0064  tRNA-Leu  90.7 
 
 
87 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  85.07 
 
 
82 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  85.07 
 
 
82 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  85.07 
 
 
82 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 
91 bp  54  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>