More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0030 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0057  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0744744  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0013  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  90.2 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000286761  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0120  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00172985  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0127  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000102689  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584266  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>