299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0004 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  90.24 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  90.14 
 
 
82 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  87.8 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  97.83 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  97.78 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  97.78 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  92.59 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  86.59 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  97.56 
 
 
83 bp  73.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  95.56 
 
 
81 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  95.56 
 
 
81 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  95.56 
 
 
84 bp  73.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  95.45 
 
 
82 bp  71.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  95.45 
 
 
82 bp  71.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  97.44 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  97.44 
 
 
88 bp  69.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  97.37 
 
 
83 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  97.37 
 
 
82 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  85.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  97.37 
 
 
82 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  86.96 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  97.22 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  97.22 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  97.14 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  97.14 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  97.14 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  84.15 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  84.15 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  86.36 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  94.74 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  84.15 
 
 
82 bp  60  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  94.74 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0057  tRNA-Leu  92.86 
 
 
80 bp  60  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0744744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  94.74 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  94.74 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  94.74 
 
 
82 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  84.15 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0069  tRNA-Leu  86.15 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365522  normal  0.0296897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0045  tRNA-Leu  86.15 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0070  tRNA-Leu  86.15 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128359 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  91.11 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  91.11 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  92.68 
 
 
81 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  91.11 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  92.68 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  92.68 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  92.68 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  92.68 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  91.11 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0066  tRNA-Leu  86.15 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  92.68 
 
 
82 bp  58  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.91 
 
 
83 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  90.91 
 
 
81 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.91 
 
 
84 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.91 
 
 
84 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  90.91 
 
 
84 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  90.91 
 
 
82 bp  56  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.91 
 
 
84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  90.91 
 
 
82 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.91 
 
 
81 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  90.91 
 
 
81 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  90.91 
 
 
81 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  90.91 
 
 
80 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  90.91 
 
 
86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  90.91 
 
 
81 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  90.91 
 
 
82 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  92.31 
 
 
86 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>