More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_tRNALeuVIMSS1309257 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0072  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0073  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0024  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0025  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0026  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0068  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0003  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0006  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0072  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t73  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t74  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0002  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217421  hitchhiker  0.000407536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0081  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.491812  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0100  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0099  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0098  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0692613  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0003  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.14318  hitchhiker  0.000405393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0054  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0097  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0752348  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0042  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.574656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1764  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000024558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0017  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00783085  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0035  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1768  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0034  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.956529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0018  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0174601  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0029  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.322054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0527  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000711336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0841  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>