More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0006 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  91.94 
 
 
87 bp  83.8  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  91.8 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  91.8 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  97.73 
 
 
81 bp  79.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  79.8  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  97.73 
 
 
81 bp  79.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  79.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  95.83 
 
 
87 bp  79.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  79.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0018  tRNA-Leu  90.32 
 
 
87 bp  75.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0174601  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  95.56 
 
 
87 bp  73.8  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  97.5 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  97.5 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  93.75 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  93.75 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00069  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000211563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  97.44 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4911  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000387587  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  97.44 
 
 
88 bp  69.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4806  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5234  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000900844  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  85.06 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4213  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  97.44 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4969  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000625029  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5882  tRNA-Leu  88.89 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.119438  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  97.44 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  95.24 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  95.24 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  95.24 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  93.48 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  90.74 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  95.24 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  90.57 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  95.12 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  95.12 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5666  tRNA-Leu  93.18 
 
 
89 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5665  tRNA-Leu  93.18 
 
 
89 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0185  tRNA-Leu  93.18 
 
 
89 bp  63.9  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0572114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>