More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0028 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  94.05 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 81 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 81 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.0000012405  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 81 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0044  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0171508  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4911  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000387587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0527  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000711336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0185  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4969  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000625029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5882  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.119438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0018  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0174601  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1764  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000024558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1768  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>