More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_tRNALeuVIMSS1309345 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0029  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309185  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0718906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1054  hypothetical protein  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0031  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309184  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0006  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0072  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0003  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0068  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0026  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.794805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0081  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.491812  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t73  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t74  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0002  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217421  hitchhiker  0.000407536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.14318  hitchhiker  0.000405393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0099  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0100  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0097  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0752348  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0098  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0692613  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.665018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  96.55 
 
 		 1389 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0101  tRNA-Leu  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000279606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  83.13 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  83.13 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>