196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0022 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  89.77 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 91 bp  69.9  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0010  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.102208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>