252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1053 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 114 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0003  tRNA-Leu  87.18 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0002  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217421  hitchhiker  0.000407536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0072  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0003  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.14318  hitchhiker  0.000405393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0098  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0692613  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0081  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.491812  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0099  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0100  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0097  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0752348  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t73  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t74  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0072  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0068  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0006  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0026  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.794805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0003    92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0012  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.145187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0007  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0003  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>