298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31720 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  90.67 
 
 		 86 bp  85.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 83 bp  85.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  90.67 
 
 		 86 bp  85.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  89.71 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  87.65 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0003  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0003  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0073  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357526  normal  0.875145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0050  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0026  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  83.56 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0026  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  100 
 
 		 1389 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  90 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0017  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777785  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  90 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1054  hypothetical protein  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>