196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3446 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0000968833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.806101  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.193422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0030  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0037  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000147646  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0001  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1768  tRNA-Leu  85 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1772  tRNA-Leu  85 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0070  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309276  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna35  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45897  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0038  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal  0.0114921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0017  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777785  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0040  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0018  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0174601  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1764  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000024558  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0004  tRNA-Leu  82.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0074  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t093  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0007  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0126  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553004  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0126  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000786823  normal  0.701139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0069  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365522  normal  0.0296897 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  96.3 
 
 		 1389 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309185  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0718906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0045  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0026  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00329777  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5114  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>