297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_rna35 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna35  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0018  tRNA-Leu  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0018  tRNA-Leu  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0077  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1614  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0026  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0025  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60360  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5466  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0065  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62800  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60600  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5666  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5665  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0073  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000187871  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0031  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0035  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0047  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.279454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0052  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888943  normal  0.34403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0035  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60590  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65210  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65220  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5072  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000520026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0010  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410025  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3481  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4701  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000616666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3660  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0342114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0012  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3481  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3470  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00513731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0038  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>