298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  97.67 
 
 		 88 bp  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0055  tRNA-Leu  96.51 
 
 		 86 bp  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 89 bp  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  96.51 
 
 		 87 bp  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  96.51 
 
 		 84 bp  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  94.19 
 
 		 85 bp  123  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  94.19 
 
 		 88 bp  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  94.19 
 
 		 88 bp  123  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 88 bp  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  91.86 
 
 		 89 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0063  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 88 bp  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  91.86 
 
 		 89 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 83 bp  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  93.59 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  93.59 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 84 bp  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  93.59 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0027  tRNA-Leu  91.86 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.787126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 89 bp  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  93.7  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 86 bp  93.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 86 bp  93.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 89 bp  93.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  93.7  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 86 bp  93.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 86 bp  93.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 86 bp  93.7  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 89 bp  93.7  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  93.7  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  91.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  92.21 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1379  tRNA-Leu  97.92 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.107567 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  97.67 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00329777  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365522  normal  0.0296897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0012  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  89.33 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  89.33 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00069  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000211563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4806  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4213  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5234  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5882  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.119438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4969  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000625029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4911  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000387587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0016  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4962  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000175711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>