More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_R0018 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  98.84 
 
 		 86 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0088  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0020  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.020101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t18  tRNA-Leu  90 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>