87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0038 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0045  tRNA-Leu  93.02 
 
 
86 bp  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  95 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  95 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  95 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  92.86 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  94.59 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  94.59 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  94.59 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  94.59 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  94.59 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  92.5 
 
 
90 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0040  tRNA-Leu  92.5 
 
 
86 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  92.31 
 
 
87 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  92.31 
 
 
89 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0045  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.612739  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  91.89 
 
 
88 bp  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.89 
 
 
88 bp  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  91.67 
 
 
92 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  90.7 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  89.74 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  89.47 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  89.47 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1224  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0795794  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  93.33 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  89.47 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>