25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_R0045 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 86 bp  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0045  tRNA-Leu  89.89 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.612739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>