208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0023 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  91.86 
 
 
86 bp  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  91.86 
 
 
85 bp  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  92.05 
 
 
87 bp  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  90.91 
 
 
87 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  89.53 
 
 
85 bp  91.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  89.77 
 
 
87 bp  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  97.87 
 
 
85 bp  85.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  97.83 
 
 
87 bp  83.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  95.74 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  90 
 
 
88 bp  77.8  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  97.62 
 
 
88 bp  75.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  95.65 
 
 
87 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  97.62 
 
 
88 bp  75.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  97.56 
 
 
92 bp  73.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  91.53 
 
 
89 bp  73.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  97.56 
 
 
92 bp  73.8  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  97.5 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  97.5 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  97.5 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  93.62 
 
 
89 bp  69.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  95.12 
 
 
88 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  95.12 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  95.12 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  95.12 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  95.12 
 
 
88 bp  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  97.56 
 
 
89 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  97.56 
 
 
89 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  95 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  95 
 
 
89 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  95 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  87.5 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  94.87 
 
 
84 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  85.06 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  93.02 
 
 
89 bp  61.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  86.21 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  85.71 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  92.86 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  92.68 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.68 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  94.59 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  94.59 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  94.59 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  92.68 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  92.68 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  96.88 
 
 
87 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  96.77 
 
 
87 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  96.67 
 
 
86 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  94.12 
 
 
88 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0031  tRNA-Leu  89.13 
 
 
87 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0756362  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  85.71 
 
 
84 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  92.11 
 
 
88 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  87.1 
 
 
85 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  94.12 
 
 
86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3171t  tRNA-Leu  90.24 
 
 
84 bp  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0569623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3174t  tRNA-Leu  90.24 
 
 
84 bp  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000836085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  91.89 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0074  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  91.89 
 
 
88 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna003  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00119641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  91.89 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna005  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.240407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  91.89 
 
 
84 bp  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>