141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0027 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  89.04 
 
 
86 bp  81.8  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  85.39 
 
 
89 bp  73.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  93.18 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  93.18 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  93.18 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  95 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  97.5 
 
 
83 bp  63.9  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.02 
 
 
89 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  93.02 
 
 
89 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  94.59 
 
 
86 bp  58  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  94.59 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.91 
 
 
85 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  90.91 
 
 
85 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  90.91 
 
 
90 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  90.91 
 
 
85 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  92.31 
 
 
84 bp  54  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0045  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  90.48 
 
 
86 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  90.48 
 
 
86 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  90.48 
 
 
86 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  90.48 
 
 
86 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  90.48 
 
 
89 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  90.48 
 
 
92 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  90.48 
 
 
88 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  96.55 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  91.89 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  91.89 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  90.24 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  91.89 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 
86 bp  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  88.64 
 
 
85 bp  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  88.64 
 
 
89 bp  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0043  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  88.37 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  91.43 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  88.37 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  93.55 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  88.37 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  88.37 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  88.1 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000281686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  88.1 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>