165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0016 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  89.89 
 
 		 89 bp  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 90 bp  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  88.76 
 
 		 89 bp  97.6  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  88.76 
 
 		 89 bp  97.6  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  88.76 
 
 		 89 bp  97.6  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  88.76 
 
 		 89 bp  97.6  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 89 bp  69.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 89 bp  69.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 89 bp  69.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 89 bp  69.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0036  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5693  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000772735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5727  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000902982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000281686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0859  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4572  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000682737  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000205761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5029  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5638  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.114187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5731  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5814  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0100  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0217  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000698181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4998  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0784  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0023  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0238053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0103  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000553911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0138  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00946878  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.020101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1224  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0795794  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 80 bp  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>