55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0040 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  92.5 
 
 
86 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 
90 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  90.48 
 
 
90 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 
90 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  83.56 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  91.89 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  91.89 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0044  tRNA-OTHER  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.450605  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  96.43 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4002  hypothetical protein  96.43 
 
 
417 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224316  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000394336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05020  tRNA-Leu  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0450088  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  89.74 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0052  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.665018  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  44.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  91.18 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  91.18 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  96.15 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0080  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  88.1 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0019  tRNA-Leu  96.15 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.614107  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>