18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0044 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0044  tRNA-OTHER  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.450605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4002  hypothetical protein  100 
 
 		 417 bp  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224316  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0014  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0040  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0015  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0048  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>