144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0002 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0487  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0373376  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0015  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0014  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt08  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00502117  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4002  hypothetical protein  96.55 
 
 		 417 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224316  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0044  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.450605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>