251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_R0021 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0030  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0016  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0051  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000403882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0064  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000032278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0023  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>