60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0045 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03620  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0256458  normal  0.0430862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0064  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000032278  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02220  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  84.27 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0039  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240942  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0034  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333155  hitchhiker  0.000426709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  84.44 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0055  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0031  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0054  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000429153  normal  0.0864889 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4326  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0025  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121967  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0899953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1246  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.157019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150369  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.784773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00533985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>