33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0055 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0064  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000032278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0033  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 100 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  85 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  85 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0032  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0047  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.665018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000498774  normal  0.0770032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07180  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000122258  normal  0.69512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10180  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000392924  hitchhiker  0.000000470652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>