183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0024 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 89 bp  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0031  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  87.64 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0062  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0064  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000032278  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0055  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.020101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>