54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0022 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0064  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000032278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0009  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03620  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0256458  normal  0.0430862 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02220  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0055  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0039  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240942  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0034  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333155  hitchhiker  0.000426709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0062  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.784773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1246  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.157019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00533985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>