67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0029 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  89.53 
 
 
86 bp  99.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0039  tRNA-Leu  87.21 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240942  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0034  tRNA-Leu  87.21 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333155  hitchhiker  0.000426709 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  86.67 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  86.67 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  86.67 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  87.78 
 
 
90 bp  69.9  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  84.88 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0062  tRNA-Leu  88.33 
 
 
83 bp  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  86.67 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  86.67 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0054  tRNA-Leu  83.72 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000429153  normal  0.0864889 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  86.49 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  86.49 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  88.24 
 
 
89 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  85.29 
 
 
86 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  96.88 
 
 
86 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  85.29 
 
 
86 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  95 
 
 
87 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0055  tRNA-Leu  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  94.29 
 
 
89 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  92.31 
 
 
83 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  94.29 
 
 
89 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  85.51 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  85.51 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0026  tRNA-Leu  85.96 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0364894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  86.54 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  89.58 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  89.58 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  88.64 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  92.5 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  83.82 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.67 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000953822  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  83.58 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  93.55 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  84.75 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  82.76 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0033  tRNA-Ser  96.3 
 
 
100 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  82.76 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  83.58 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  88.37 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  92.11 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  92.11 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  90.48 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  92.11 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>