53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1246 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1246  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.157019  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  98.85 
 
 		 87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00533985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0044  tRNA-Leu  98.85 
 
 		 87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.784773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0064  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000032278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>