67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0014 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.036867  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0017  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_662  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.927512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  95.92 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0057  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  87.93 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0955  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0134122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0055  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>