182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0923 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  151  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 84 bp  151  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  92.96 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.55 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 89 bp  83.8  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  90.28 
 
 		 88 bp  79.8  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0064  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000032278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>